SQL Server on Linux はマンスリーアップデートで、新しいバージョンが公開されます。
2017/1/22 時点は CTP 1.2 がリリースされています。
CTP 1.2 の変更点については以下になります。
What’s New in SQL Server vNext
SQL Server on Linux のマンスリーアップデートの適用ですが、以下で対応できるかと。
sudo apt-get update sudo apt-get install mssql-server
SQL Server on Linux のメインのプログラムは sfp にパックされた形で構成されているため、再度インストールすると sfp が入れ替えられ、SQL Server の構成ファイルやシステムデータベースはそのまま残した状態で新しいものに入れ替えられるようです。
システムデータベースのバージョンアップは実行されていると思いますので、古い CTP のバージョンに戻すことはできないと思いますが、上位には変更することが可能です。