SQL Server のインストール時には [インスタンス ルート ディレクトリ] を指定するのですが、これと Windows Server バックアップには少し関連性があるので今回はこの点についてまとめてみたいと思います。
今回は Windows Server 2008 R2 上での動作となり、Windows Server 2012 R2 で試してみたところ、インスタンスルートディレクトリが、ベアメタル回復用のバックアップ取得時に選択されるということはありませんでした。
OS のバージョンによって動作が異なっているようですね。