現状、SQL Database の設定管理は T-SQL で実施することになります。
どんなオブジェクトが作成されているかは GUI から確認できますが、細かな設定に関しては SQL で設定 / 取得する必要があります。
セキュリティ関連の設定について、どのように設定するかの基本パターンをメモとして。
ログインとユーザーの情報については
SQL Azure におけるデータベースとログインの管理
Windows Azure SQL データベースにおけるデータベースとログインの管理