SQL Server 2016 では、AlwaysOn で DTC (分散トランザクション) がサポートされるとアナウンスされています。
これに関連する情報を軽くまとめてみたいと思います。
2016/4/15 追記
最新の情報を確認したところ、Windows Server 2012 R2 に KB?3090973 をインストールすることで、DTC がサポートされるらしいです。
Availability Groups must be running on Windows Server 2016 or Windows Server 2012 R2. For Windows Server 2012 R2, you must install the update in KB3090973 available at https://support.microsoft.com/en-us/kb/3090973.